Hispana. Acceso en línea al Patrimonio Cultural Digital Español

Está en:  › Dades de registre

A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens

Identificadores del recurso

http://hdl.handle.net/10803/687495

Procedència

(Tesis de la Universitat de Lleida)

Fitxa

Títol:: A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens
Tema:: Estres; Xarxes bayesianes; Benestar animal; Redes bayesianas; Bienestar animal; Stress; Bayesian networks; Animal welfare; Genètica; 573
Descripció:: Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.; Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.; Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.
Font:: TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
Idioma:: English
Autor/Productor:: Videla Rodríguez, Emiliano
Editor:: Universitat de Lleida
Otros colaboradores/productores:: Smith, Victoria Anne; Medina Hernández, Loreta Mª; Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental
Drets:: ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.; info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
Data:: 2023-01-25T12:00:54Z; 2022-10-21; 2023-10-21T02:00:00Z
Tipo de recurso:: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis; info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Format:: 174 p.; application/pdf

oai_dc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<oai_dc:dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
1. <dc:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dc:title>
2. <dc:creator>Videla Rodríguez, Emiliano</dc:creator>
3. <dc:contributor>Smith, Victoria Anne</dc:contributor>
4. <dc:contributor>Medina Hernández, Loreta Mª</dc:contributor>
5. <dc:contributor>Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</dc:contributor>
6. <dc:subject>Estres</dc:subject>
7. <dc:subject>Xarxes bayesianes</dc:subject>
8. <dc:subject>Benestar animal</dc:subject>
9. <dc:subject>Redes bayesianas</dc:subject>
10. <dc:subject>Bienestar animal</dc:subject>
11. <dc:subject>Stress</dc:subject>
12. <dc:subject>Bayesian networks</dc:subject>
13. <dc:subject>Animal welfare</dc:subject>
14. <dc:subject>Genètica</dc:subject>
15. <dc:subject>573</dc:subject>
16. <dc:description>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dc:description>
17. <dc:description>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dc:description>
18. <dc:description>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dc:description>
19. <dc:date>2023-01-25T12:00:54Z</dc:date>
20. <dc:date>2022-10-21</dc:date>
21. <dc:date>2023-10-21T02:00:00Z</dc:date>
22. <dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
23. <dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
24. <dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/687495</dc:identifier>
25. <dc:language>eng</dc:language>
26. <dc:rights>ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</dc:rights>
27. <dc:rights>info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</dc:rights>
28. <dc:format>174 p.</dc:format>
29. <dc:format>application/pdf</dc:format>
30. <dc:publisher>Universitat de Lleida</dc:publisher>
31. <dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
</oai_dc:dc>

dim

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<dim:dim schemaLocation="http://www.dspace.org/xmlns/dspace/dim http://www.dspace.org/schema/dim.xsd">
1. <dim:field element="contributor" mdschema="dc">Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</dim:field>
2. <dim:field authority="c5d86864-410a-4640-a218-fc8075292766" element="contributor" mdschema="dc" qualifier="author">Videla Rodríguez, Emiliano</dim:field>
3. <dim:field element="contributor" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="authoremailshow">false</dim:field>
4. <dim:field element="contributor" mdschema="dc" qualifier="director">Smith, Victoria Anne</dim:field>
5. <dim:field element="contributor" mdschema="dc" qualifier="tutor">Medina Hernández, Loreta Mª</dim:field>
6. <dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="accessioned">2023-01-25T12:00:54Z</dim:field>
7. <dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="issued">2022-10-21</dim:field>
8. <dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="embargoEnd">2023-10-21T02:00:00Z</dim:field>
9. <dim:field element="identifier" mdschema="dc" qualifier="uri">http://hdl.handle.net/10803/687495</dim:field>
10. <dim:field element="description" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="abstract">Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dim:field>
11. <dim:field element="description" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="abstract">Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dim:field>
12. <dim:field element="description" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="abstract">Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dim:field>
13. <dim:field element="format" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="extent">174 p.</dim:field>
14. <dim:field element="language" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="iso">eng</dim:field>
15. <dim:field element="publisher" mdschema="dc">Universitat de Lleida</dim:field>
16. <dim:field element="rights" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="license">ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</dim:field>
17. <dim:field element="rights" mdschema="dc" qualifier="accessLevel">info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</dim:field>
18. <dim:field element="source" mdschema="dc">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dim:field>
19. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Estres</dim:field>
20. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Xarxes bayesianes</dim:field>
21. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Benestar animal</dim:field>
22. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Redes bayesianas</dim:field>
23. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Bienestar animal</dim:field>
24. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Stress</dim:field>
25. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Bayesian networks</dim:field>
26. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc">Animal welfare</dim:field>
27. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="other">Genètica</dim:field>
28. <dim:field element="subject" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="udc">573</dim:field>
29. <dim:field element="title" lang="ca" mdschema="dc">A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dim:field>
30. <dim:field element="type" mdschema="dc">info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dim:field>
31. <dim:field element="type" mdschema="dc">info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dim:field>
32. <dim:field element="embargo" lang="ca" mdschema="dc" qualifier="terms">12 mesos</dim:field>
</dim:dim>

etdms

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<thesis schemaLocation="http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/ http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/etdms.xsd">
1. <title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</title>
2. <creator>Videla Rodríguez, Emiliano</creator>
3. <contributor>false</contributor>
4. <contributor>Smith, Victoria Anne</contributor>
5. <contributor>Medina Hernández, Loreta Mª</contributor>
6. <subject>Estres</subject>
7. <subject>Xarxes bayesianes</subject>
8. <subject>Benestar animal</subject>
9. <subject>Redes bayesianas</subject>
10. <subject>Bienestar animal</subject>
11. <subject>Stress</subject>
12. <subject>Bayesian networks</subject>
13. <subject>Animal welfare</subject>
14. <description>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</description>
15. <description>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</description>
16. <description>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</description>
17. <date>2023-01-25</date>
18. <date>2022-10-21</date>
19. <date>2023-10-21</date>
20. <type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</type>
21. <type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</type>
22. <identifier>http://hdl.handle.net/10803/687495</identifier>
23. <language>eng</language>
24. <rights>ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</rights>
25. <rights>info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</rights>
26. <publisher>Universitat de Lleida</publisher>
27. <source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</source>
</thesis>

marc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<record schemaLocation="http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd">
1. <leader>00925njm 22002777a 4500</leader>
2. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="042">
  1. <subfield code="a">dc</subfield>
  </datafield>
3. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="720">
  1. <subfield code="a">Videla Rodríguez, Emiliano</subfield>
  2. <subfield code="e">author</subfield>
  </datafield>
4. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="260">
  1. <subfield code="c">2022-10-21</subfield>
  </datafield>
5. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
  1. <subfield code="a">Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</subfield>
  </datafield>
6. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
  1. <subfield code="a">Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</subfield>
  </datafield>
7. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
  1. <subfield code="a">Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</subfield>
  </datafield>
8. <datafield ind1="8" ind2=" " tag="024">
  1. <subfield code="a">http://hdl.handle.net/10803/687495</subfield>
  </datafield>
9. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Estres</subfield>
  </datafield>
10. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Xarxes bayesianes</subfield>
  </datafield>
11. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Benestar animal</subfield>
  </datafield>
12. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Redes bayesianas</subfield>
  </datafield>
13. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Bienestar animal</subfield>
  </datafield>
14. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Stress</subfield>
  </datafield>
15. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Bayesian networks</subfield>
  </datafield>
16. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Animal welfare</subfield>
  </datafield>
17. <datafield ind1="0" ind2="0" tag="245">
  1. <subfield code="a">A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</subfield>
  </datafield>
</record>

marc_ccuc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<record schemaLocation="http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd">
1. <leader>nam a 5i 4500</leader>
2. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Estres</subfield>
  </datafield>
3. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Xarxes bayesianes</subfield>
  </datafield>
4. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Benestar animal</subfield>
  </datafield>
5. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Redes bayesianas</subfield>
  </datafield>
6. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Bienestar animal</subfield>
  </datafield>
7. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Stress</subfield>
  </datafield>
8. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Bayesian networks</subfield>
  </datafield>
9. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
  1. <subfield code="a">Animal welfare</subfield>
  </datafield>
10. <datafield ind1="1" ind2="0" tag="245">
  1. <subfield code="a">A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</subfield>
  </datafield>
11. <datafield ind1=" " ind2="1" tag="264">
  1. <subfield code="a">[Lleida] :</subfield>
  2. <subfield code="b">Universitat de Lleida,</subfield>
  3. <subfield code="c">2023</subfield>
  </datafield>
12. <datafield ind1="4" ind2="0" tag="856">
  1. <subfield code="z">Accés lliure</subfield>
  2. <subfield code="u">http://hdl.handle.net/10803/687495</subfield>
  </datafield>
13. <controlfield tag="007">cr |||||||||||</controlfield>
14. <controlfield tag="008">AAMMDDs2023 sp ||||fsm||||0|| 0 eng|c</controlfield>
15. <datafield ind1="1" ind2=" " tag="100">
  1. <subfield code="a">Videla Rodríguez, Emiliano,</subfield>
  2. <subfield code="e">autor</subfield>
  </datafield>
16. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="300">
  1. <subfield code="a">1 recurs en línia (174 pàgines)</subfield>
  </datafield>
17. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="502">
  1. <subfield code="g">Tesi</subfield>
  2. <subfield code="b">Doctorat</subfield>
  3. <subfield code="c">Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</subfield>
  4. <subfield code="d">2022</subfield>
  </datafield>
18. <datafield ind1="2" ind2=" " tag="710">
  1. <subfield code="a">Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</subfield>
  </datafield>
19. <datafield ind1=" " ind2="4" tag="655">
  1. <subfield code="a">Tesis i dissertacions electròniques</subfield>
  </datafield>
20. <datafield ind1="1" ind2=" " tag="700">
  1. <subfield code="a">Smith, Victoria Anne,</subfield>
  2. <subfield code="e">supervisor acadèmic</subfield>
  </datafield>
21. <datafield ind1="1" ind2=" " tag="700">
  1. <subfield code="a">Medina Hernández, Loreta Mª,</subfield>
  2. <subfield code="e">supervisor acadèmic</subfield>
  </datafield>
22. <datafield ind1="0" ind2=" " tag="730">
  1. <subfield code="a">TDX</subfield>
  </datafield>
23. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
  1. <subfield code="a">Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</subfield>
  </datafield>
24. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="998">
  1. <subfield code="a">l</subfield>
  </datafield>
25. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="040">
  1. <subfield code="a">ES-BaCBU</subfield>
  2. <subfield code="b">cat</subfield>
  3. <subfield code="e">rda</subfield>
  4. <subfield code="c">ES-BaCBU</subfield>
  </datafield>
26. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="336">
  1. <subfield code="a">text</subfield>
  2. <subfield code="b">txt</subfield>
  3. <subfield code="2">rdacontent</subfield>
  </datafield>
27. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="337">
  1. <subfield code="a">informàtic</subfield>
  2. <subfield code="b">c</subfield>
  3. <subfield code="2">rdamedia</subfield>
  </datafield>
28. <datafield ind1=" " ind2=" " tag="338">
  1. <subfield code="a">recurs en línia</subfield>
  2. <subfield code="b">cr</subfield>
  3. <subfield code="2">rdacarrier</subfield>
  </datafield>
</record>

mets

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<mets ID=" DSpace_ITEM_10803-687495" OBJID=" hdl:10803/687495" PROFILE="DSpace METS SIP Profile 1.0" TYPE="DSpace ITEM" schemaLocation="http://www.loc.gov/METS/ http://www.loc.gov/standards/mets/mets.xsd">
1. <metsHdr CREATEDATE="2023-03-29T20:05:54Z">
  1. <agent ROLE="CUSTODIAN" TYPE="ORGANIZATION">
    1. <name>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</name>
    </agent>
  </metsHdr>
2. <dmdSec ID="DMD_10803_687495">
  1. <mdWrap MDTYPE="MODS">
    1. <xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
      1. <mods:mods schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
        <mods:name>
        <mods:role>
        <mods:roleTerm type="text">author</mods:roleTerm>
        </mods:role>
        <mods:namePart>Videla Rodríguez, Emiliano</mods:namePart>
        </mods:name>
        <mods:name>
        <mods:role>
        <mods:roleTerm type="text">authoremailshow</mods:roleTerm>
        </mods:role>
        <mods:namePart>false</mods:namePart>
        </mods:name>
        <mods:name>
        <mods:role>
        <mods:roleTerm type="text">director</mods:roleTerm>
        </mods:role>
        <mods:namePart>Smith, Victoria Anne</mods:namePart>
        </mods:name>
        <mods:name>
        <mods:role>
        <mods:roleTerm type="text">tutor</mods:roleTerm>
        </mods:role>
        <mods:namePart>Medina Hernández, Loreta Mª</mods:namePart>
        </mods:name>
        <mods:extension>
        <mods:dateAccessioned encoding="iso8601">2023-01-25T12:00:54Z</mods:dateAccessioned>
        </mods:extension>
        <mods:originInfo>
        <mods:dateIssued encoding="iso8601">2022-10-21</mods:dateIssued>
        </mods:originInfo>
        <mods:identifier type="uri">http://hdl.handle.net/10803/687495</mods:identifier>
        <mods:abstract>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</mods:abstract>
        <mods:language>
        <mods:languageTerm authority="rfc3066">eng</mods:languageTerm>
        </mods:language>
        <mods:accessCondition type="useAndReproduction" />
        <mods:subject>
        <mods:topic>Estres</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Xarxes bayesianes</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Benestar animal</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Redes bayesianas</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Bienestar animal</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Stress</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Bayesian networks</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:subject>
        <mods:topic>Animal welfare</mods:topic>
        </mods:subject>
        <mods:titleInfo>
        <mods:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</mods:title>
        </mods:titleInfo>
        <mods:genre>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion</mods:genre>
        </mods:mods>
      </xmlData>
    </mdWrap>
  </dmdSec>
3. <amdSec ID="FO_10803_687495_2">
  1. <techMD ID="TECH_O_10803_687495_2">
    1. <mdWrap MDTYPE="PREMIS">
      1. <xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd">
        <premis:premis>
        <premis:object>
        <premis:objectIdentifier>
        <premis:objectIdentifierType>URL</premis:objectIdentifierType>
        <premis:objectIdentifierValue>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf</premis:objectIdentifierValue>
        </premis:objectIdentifier>
        <premis:objectCategory>File</premis:objectCategory>
        <premis:objectCharacteristics>
        <premis:fixity>
        <premis:messageDigestAlgorithm>MD5</premis:messageDigestAlgorithm>
        <premis:messageDigest>3c32751aa83d6f2cc80666958a49a379</premis:messageDigest>
        </premis:fixity>
        <premis:size>1929158</premis:size>
        <premis:format>
        <premis:formatDesignation>
        <premis:formatName>application/pdf</premis:formatName>
        </premis:formatDesignation>
        </premis:format>
        </premis:objectCharacteristics>
        <premis:originalName>Teavr1de1.pdf</premis:originalName>
        </premis:object>
        </premis:premis>
        </xmlData>
      </mdWrap>
    </techMD>
  </amdSec>
4. <amdSec ID="FT_10803_687495_3">
  1. <techMD ID="TECH_T_10803_687495_3">
    1. <mdWrap MDTYPE="PREMIS">
      1. <xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd">
        <premis:premis>
        <premis:object>
        <premis:objectIdentifier>
        <premis:objectIdentifierType>URL</premis:objectIdentifierType>
        <premis:objectIdentifierValue>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/3/Teavr1de1.pdf.txt</premis:objectIdentifierValue>
        </premis:objectIdentifier>
        <premis:objectCategory>File</premis:objectCategory>
        <premis:objectCharacteristics>
        <premis:fixity>
        <premis:messageDigestAlgorithm>MD5</premis:messageDigestAlgorithm>
        <premis:messageDigest>a646915d5b7376dfc10e2516c6e6ee53</premis:messageDigest>
        </premis:fixity>
        <premis:size>324968</premis:size>
        <premis:format>
        <premis:formatDesignation>
        <premis:formatName>text/plain</premis:formatName>
        </premis:formatDesignation>
        </premis:format>
        </premis:objectCharacteristics>
        <premis:originalName>Teavr1de1.pdf.txt</premis:originalName>
        </premis:object>
        </premis:premis>
        </xmlData>
      </mdWrap>
    </techMD>
  </amdSec>
5. <fileSec>
  1. <fileGrp USE="ORIGINAL">
    1. <file ADMID="FO_10803_687495_2" CHECKSUM="3c32751aa83d6f2cc80666958a49a379" CHECKSUMTYPE="MD5" GROUPID="GROUP_BITSTREAM_10803_687495_2" ID="BITSTREAM_ORIGINAL_10803_687495_2" MIMETYPE="application/pdf" SEQ="2" SIZE="1929158">
      1. <FLocat LOCTYPE="URL" href="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf" type="simple" />
      </file>
    </fileGrp>
  2. <fileGrp USE="TEXT">
    1. <file ADMID="FT_10803_687495_3" CHECKSUM="a646915d5b7376dfc10e2516c6e6ee53" CHECKSUMTYPE="MD5" GROUPID="GROUP_BITSTREAM_10803_687495_3" ID="BITSTREAM_TEXT_10803_687495_3" MIMETYPE="text/plain" SEQ="3" SIZE="324968">
      1. <FLocat LOCTYPE="URL" href="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/3/Teavr1de1.pdf.txt" type="simple" />
      </file>
    </fileGrp>
  </fileSec>
6. <structMap LABEL="DSpace Object" TYPE="LOGICAL">
  1. <div ADMID="DMD_10803_687495" TYPE="DSpace Object Contents">
    1. <div TYPE="DSpace BITSTREAM">
      1. <fptr FILEID="BITSTREAM_ORIGINAL_10803_687495_2" />
      </div>
    </div>
  </structMap>
</mets>

mods

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<mods:mods schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
1. <mods:name>
  1. <mods:namePart>Videla Rodríguez, Emiliano</mods:namePart>
  </mods:name>
2. <mods:extension>
  1. <mods:dateAvailable encoding="iso8601">2023-01-25T12:00:54Z</mods:dateAvailable>
  </mods:extension>
3. <mods:originInfo>
  1. <mods:dateIssued encoding="iso8601">2022-10-21</mods:dateIssued>
  </mods:originInfo>
4. <mods:identifier type="uri">http://hdl.handle.net/10803/687495</mods:identifier>
5. <mods:abstract>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</mods:abstract>
6. <mods:abstract>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</mods:abstract>
7. <mods:abstract>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</mods:abstract>
8. <mods:language>
  1. <mods:languageTerm>eng</mods:languageTerm>
  </mods:language>
9. <mods:accessCondition type="useAndReproduction">ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</mods:accessCondition>
10. <mods:accessCondition type="useAndReproduction">info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</mods:accessCondition>
11. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Estres</mods:topic>
  </mods:subject>
12. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Xarxes bayesianes</mods:topic>
  </mods:subject>
13. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Benestar animal</mods:topic>
  </mods:subject>
14. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Redes bayesianas</mods:topic>
  </mods:subject>
15. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Bienestar animal</mods:topic>
  </mods:subject>
16. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Stress</mods:topic>
  </mods:subject>
17. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Bayesian networks</mods:topic>
  </mods:subject>
18. <mods:subject>
  1. <mods:topic>Animal welfare</mods:topic>
  </mods:subject>
19. <mods:titleInfo>
  1. <mods:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</mods:title>
  </mods:titleInfo>
20. <mods:genre>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</mods:genre>
21. <mods:genre>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</mods:genre>
</mods:mods>

oaire

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<oaire:record schemaLocation="http://namespaceopenaire.eu/schema/oaire/">
1. <dc:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dc:title>
2. <datacite:creator>
  1. <datacite:creatorName>Videla Rodríguez, Emiliano</datacite:creatorName>
  </datacite:creator>
3. <datacite:contributor>false</datacite:contributor>
4. <datacite:contributor>Smith, Victoria Anne</datacite:contributor>
5. <datacite:contributor>Medina Hernández, Loreta Mª</datacite:contributor>
6. <datacite:contributor>Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</datacite:contributor>
7. <dc:subject>Estres</dc:subject>
8. <dc:subject>Xarxes bayesianes</dc:subject>
9. <dc:subject>Benestar animal</dc:subject>
10. <dc:subject>Redes bayesianas</dc:subject>
11. <dc:subject>Bienestar animal</dc:subject>
12. <dc:subject>Stress</dc:subject>
13. <dc:subject>Bayesian networks</dc:subject>
14. <dc:subject>Animal welfare</dc:subject>
15. <dc:subject>Genètica</dc:subject>
16. <dc:subject>573</dc:subject>
17. <dc:description>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dc:description>
18. <dc:description>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dc:description>
19. <dc:description>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dc:description>
20. <dc:date>2023-01-25T12:00:54Z</dc:date>
21. <dc:date>2022-10-21</dc:date>
22. <dc:date>2023-10-21T02:00:00Z</dc:date>
23. <dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
24. <dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
25. <datacite:alternateIdentifier>http://hdl.handle.net/10803/687495</datacite:alternateIdentifier>
26. <dc:language>eng</dc:language>
27. <dc:rights>ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</dc:rights>
28. <dc:rights>info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</dc:rights>
29. <dc:format>174 p.</dc:format>
30. <dc:format>application/pdf</dc:format>
31. <dc:publisher>Universitat de Lleida</dc:publisher>
32. <dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
33. <oaire:file>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf</oaire:file>
</oaire:record>

ore

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<atom:entry schemaLocation="http://www.w3.org/2005/Atom http://www.kbcafe.com/rss/atom.xsd.xml">
1. <atom:id>http://hdl.handle.net/10803/687495/ore.xml</atom:id>
2. <atom:link href="http://hdl.handle.net/10803/687495" rel="alternate" />
3. <atom:link href="http://hdl.handle.net/10803/687495/ore.xml" rel="http://www.openarchives.org/ore/terms/describes" />
4. <atom:link href="http://hdl.handle.net/10803/687495/ore.xml#atom" rel="self" type="application/atom+xml" />
5. <atom:published />
6. <atom:updated>2023-01-25T12:00:54Z</atom:updated>
7. <atom:source>
  1. <atom:generator>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</atom:generator>
  </atom:source>
8. <atom:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</atom:title>
9. <atom:author>
  1. <atom:name>Videla Rodríguez, Emiliano</atom:name>
  </atom:author>
10. <atom:category label="Aggregation" scheme="http://www.openarchives.org/ore/terms/" term="http://www.openarchives.org/ore/terms/Aggregation" />
11. <atom:category scheme="http://www.openarchives.org/ore/atom/modified" term="2023-01-25T12:00:54Z" />
12. <atom:category label="DSpace Item" scheme="http://www.dspace.org/objectModel/" term="DSpaceItem" />
13. <atom:link href="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf" length="1929158" rel="http://www.openarchives.org/ore/terms/aggregates" title="Teavr1de1.pdf" type="application/pdf" />
14. <oreatom:triples>
  1. <rdf:Description about="http://hdl.handle.net/10803/687495/ore.xml#atom">
    1. <rdf:type resource="http://www.dspace.org/objectModel/DSpaceItem" />
    2. <dcterms:modified>2023-01-25T12:00:54Z</dcterms:modified>
    </rdf:Description>
  2. <rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf">
    1. <rdf:type resource="http://www.dspace.org/objectModel/DSpaceBitstream" />
    2. <dcterms:description>ORIGINAL</dcterms:description>
    </rdf:Description>
  3. <rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/3/Teavr1de1.pdf.txt">
    1. <rdf:type resource="http://www.dspace.org/objectModel/DSpaceBitstream" />
    2. <dcterms:description>TEXT</dcterms:description>
    </rdf:Description>
  4. <rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/4/Teavr1de1.pdf.xml">
    1. <rdf:type resource="http://www.dspace.org/objectModel/DSpaceBitstream" />
    2. <dcterms:description>MEDIA_DOCUMENT</dcterms:description>
    </rdf:Description>
  </oreatom:triples>
</atom:entry>

qdc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<qdc:qualifieddc schemaLocation="http://purl.org/dc/elements/1.1/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dc.xsd http://purl.org/dc/terms/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dcterms.xsd http://dspace.org/qualifieddc/ http://www.ukoln.ac.uk/metadata/dcmi/xmlschema/qualifieddc.xsd">
1. <dc:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dc:title>
2. <dc:creator>Videla Rodríguez, Emiliano</dc:creator>
3. <dc:contributor>Smith, Victoria Anne</dc:contributor>
4. <dc:contributor>Medina Hernández, Loreta Mª</dc:contributor>
5. <dc:subject>Estres</dc:subject>
6. <dc:subject>Xarxes bayesianes</dc:subject>
7. <dc:subject>Benestar animal</dc:subject>
8. <dc:subject>Redes bayesianas</dc:subject>
9. <dc:subject>Bienestar animal</dc:subject>
10. <dc:subject>Stress</dc:subject>
11. <dc:subject>Bayesian networks</dc:subject>
12. <dc:subject>Animal welfare</dc:subject>
13. <dcterms:abstract>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dcterms:abstract>
14. <dcterms:abstract>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dcterms:abstract>
15. <dcterms:abstract>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dcterms:abstract>
16. <dcterms:issued>2022-10-21</dcterms:issued>
17. <dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
18. <dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
19. <dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/687495</dc:identifier>
20. <dc:language>eng</dc:language>
21. <dc:rights>ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</dc:rights>
22. <dc:rights>info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</dc:rights>
23. <dc:publisher>Universitat de Lleida</dc:publisher>
24. <dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
</qdc:qualifieddc>

rdf

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<rdf:RDF schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf.xsd">
1. <ow:Publication about="oai:www.tdx.cat:10803/687495">
  1. <dc:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dc:title>
  2. <dc:creator>Videla Rodríguez, Emiliano</dc:creator>
  3. <dc:contributor>false</dc:contributor>
  4. <dc:contributor>Smith, Victoria Anne</dc:contributor>
  5. <dc:contributor>Medina Hernández, Loreta Mª</dc:contributor>
  6. <dc:subject>Estres</dc:subject>
  7. <dc:subject>Xarxes bayesianes</dc:subject>
  8. <dc:subject>Benestar animal</dc:subject>
  9. <dc:subject>Redes bayesianas</dc:subject>
  10. <dc:subject>Bienestar animal</dc:subject>
  11. <dc:subject>Stress</dc:subject>
  12. <dc:subject>Bayesian networks</dc:subject>
  13. <dc:subject>Animal welfare</dc:subject>
  14. <dc:description>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dc:description>
  15. <dc:description>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dc:description>
  16. <dc:description>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dc:description>
  17. <dc:date>2023-01-25T12:00:54Z</dc:date>
  18. <dc:date>2022-10-21</dc:date>
  19. <dc:date>2023-10-21T02:00:00Z</dc:date>
  20. <dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
  21. <dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
  22. <dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/687495</dc:identifier>
  23. <dc:language>eng</dc:language>
  24. <dc:rights>ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</dc:rights>
  25. <dc:rights>info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</dc:rights>
  26. <dc:publisher>Universitat de Lleida</dc:publisher>
  27. <dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
  </ow:Publication>
</rdf:RDF>

uketd_dc

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<uketd_dc:uketddc schemaLocation="http://naca.central.cranfield.ac.uk/ethos-oai/2.0/ http://naca.central.cranfield.ac.uk/ethos-oai/2.0/uketd_dc.xsd">
1. <dc:title>A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</dc:title>
2. <dc:creator>Videla Rodríguez, Emiliano</dc:creator>
3. <dcterms:abstract>Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</dcterms:abstract>
4. <dcterms:abstract>Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</dcterms:abstract>
5. <dcterms:abstract>Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</dcterms:abstract>
6. <uketdterms:institution>Universitat de Lleida</uketdterms:institution>
7. <dcterms:issued>2022-10-21</dcterms:issued>
8. <dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
9. <dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
10. <dc:language type="dcterms:ISO639-2">eng</dc:language>
11. <dcterms:isReferencedBy>http://hdl.handle.net/10803/687495</dcterms:isReferencedBy>
12. <dc:identifier type="dcterms:URI">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf</dc:identifier>
13. <uketdterms:checksum type="uketdterms:MD5">3c32751aa83d6f2cc80666958a49a379</uketdterms:checksum>
14. <dcterms:hasFormat>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/3/Teavr1de1.pdf.txt</dcterms:hasFormat>
15. <uketdterms:checksum type="uketdterms:MD5">a646915d5b7376dfc10e2516c6e6ee53</uketdterms:checksum>
16. <uketdterms:embargodate>12 mesos</uketdterms:embargodate>
17. <dc:subject>Estres</dc:subject>
18. <dc:subject>Xarxes bayesianes</dc:subject>
19. <dc:subject>Benestar animal</dc:subject>
20. <dc:subject>Redes bayesianas</dc:subject>
21. <dc:subject>Bienestar animal</dc:subject>
22. <dc:subject>Stress</dc:subject>
23. <dc:subject>Bayesian networks</dc:subject>
24. <dc:subject>Animal welfare</dc:subject>
25. <dc:subject>Genètica</dc:subject>
</uketd_dc:uketddc>

xoai

Descarregar XML

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>

<metadata schemaLocation="http://www.lyncode.com/xoai http://www.lyncode.com/xsd/xoai.xsd">
1. <element name="dc">
  1. <element name="contributor">
    1. <element name="none">
      1. <field name="value">Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental</field>
      </element>
    2. <element name="author">
      1. <element name="none">
        <field name="value">Videla Rodríguez, Emiliano</field>
        <field name="authority">c5d86864-410a-4640-a218-fc8075292766</field>
        </element>
      </element>
    3. <element name="authoremailshow">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">false</field>
        </element>
      </element>
    4. <element name="director">
      1. <element name="none">
        <field name="value">Smith, Victoria Anne</field>
        </element>
      </element>
    5. <element name="tutor">
      1. <element name="none">
        <field name="value">Medina Hernández, Loreta Mª</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  2. <element name="date">
    1. <element name="accessioned">
      1. <element name="none">
        <field name="value">2023-01-25T12:00:54Z</field>
        </element>
      </element>
    2. <element name="issued">
      1. <element name="none">
        <field name="value">2022-10-21</field>
        </element>
      </element>
    3. <element name="embargoEnd">
      1. <element name="none">
        <field name="value">2023-10-21T02:00:00Z</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  3. <element name="identifier">
    1. <element name="uri">
      1. <element name="none">
        <field name="value">http://hdl.handle.net/10803/687495</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  4. <element name="description">
    1. <element name="abstract">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">Comprendre sistemes biològics pot ser una tasca difícil i desafiadora. L'estrès pot ser considerat com un d'aquests sistemes biològics: és un fenomen complex la percepció i la integració del qual comença al cervell, gatillant la resposta d'estrès amb moltes implicacions en la productivitat, l'estat de salut, i el benestar d'aus de corral. En el camp de la genètica i epigenètica, centenars de milers de marcadors genètics/epigenètics poden ser quantificats per individu entre aus no estressades i estressades. La genètica de l'estrès pot ser explorada en profunditat mitjançant l'aplicació d'algorismes de xarxes Bayesianes (BN) per tal d'identificar variables genètiques claus associades amb l'estrès i descobrir interaccions ocultes entre elles. Les BN són gràfics acíclics dirigits que representen les distribucions de probabilitats conjuntes d'un conjunt definit de variables; consisteixen en un conjunt de nodes, que representen les variables, i un conjunt de fletxes, que representen les relacions entre nodes. En aquest context, els objectius d‟aquesta tesi van ser recol·lectar dades provinents d‟altres estudis i identificar un conjunt reduït de variables genètiques associades al‟estrès en pollastres (Gallus gallus), descobrint relacions i interaccions informatives mitjançant l‟aplicació d‟algorismes de BNs. Dos conjunts de dades genètiques i un d'epigenètic que van avaluar els efectes de l'estrès en pollastres van ser explorats. La biologia darrere de les dades va demostrar que els gens i les variables epigenètiques estan relacionades a l'activitat de Proteïnes d'Estrès Tèrmic, vies apoptòtiques i de dany de l'AND en conjunt amb mecanismes de reparació de teixits, i la funcionalitat d'unions adherents. Aquestes variables genètiques podrien resultar crucials sota condicions d'estrès, especialment aquelles amb un rol de protecció del funcionament correcte d'altres proteïnes o estructures. Considerar aquests gens com a marcadors clau de l'estrès requeriria estudis futurs a curt i llarg termini, per tal de millorar la salut i el benestar d'ocells de corral en qüestió de maneig i programes de cria.</field>
        <field name="value">Comprender sistemas biológicos puede ser una tarea difícil y desafiante. El estrés puede ser considerado como uno de estos sistemas biológicos: es un fenómeno complejo cuya percepción e integración comienza en el cerebro, gatillando la respuesta de estrés con muchas implicancias en la productividad, el estado de salud, y el bienestar de aves de corral. En el campo de la genética y epigenética, cientos de miles de marcadores genéticos/epigenéticos pueden ser cuantificados por individuo entre aves no estresadas y estresadas. La genética del estrés puede ser explorada en profundidad mediante la aplicación de algoritmos de redes Bayesianas (BN) con el fin de identificar variables genéticas claves asociadas con el estrés como así también para descubrir interacciones ocultas entre ellas. Las BNs son gráficos acíclicos dirigidos que representan las distribuciones de probabilidades conjuntas de un conjunto definido de variables; consisten en un conjunto de nodos, que representan las variables, y un conjunto de flechas, que representan las relaciones entre nodos. En este contexto, los objetivos de esta tesis fueron recolectar datos provenientes de otros estudios e identificar un conjunto reducido de variables genéticas asociadas al estrés en pollos (Gallus gallus), descubriendo relaciones e interacciones informativas mediante la aplicación de algoritmos de BNs. Dos conjuntos de datos genéticos y uno epigenético que evaluaron los efectos del estrés en pollos fueron explorados. La biología detrás de los datos demostró que los genes y variables epigenéticas están relacionadas a la actividad de Proteínas de Estrés Térmico, vías apoptóticas y de daño del AND en conjunto con mecanismos de reparación de tejidos, y la funcionalidad de uniones adherentes. Estas variables genéticas podrían resultar cruciales bajo condiciones de estrés, especialmente aquellas con un rol de protección del correcto funcionamiento de otras proteínas o estructuras. Considerar a estos genes como marcadores clave del estrés requeriría estudios futuros a corto y largo plazo, con el fin de mejorar la salud y el bienestar de aves de corral en cuestión de manejo y programas de cría.</field>
        <field name="value">Understanding biological systems can be a very difficult and challenging task. Stress can be considered as one of these biological systems: it is a complex phenomenon which perception and integration starts in the brain, triggering the stress response with many implications on performance, health status, and welfare of poultry species. In the field of genetics and epigenetics, hundreds of thousands of genetic/epigenetic markers can be measured per individual between non-stressed and stressed birds. The genetics of stress can be further explored by the application of Bayesian network (BN) algorithms with the aim of identifying hallmark genetic features associated with stress as well as unravelling hidden interactions between them. BNs are directed acyclic graphs that represent the joint probability distributions of a given set of variables; they consist of a set of nodes, which represent the variables, and a set of arcs or edges, representing the relationships between nodes. In this context, the aims of the current thesis were to collect data from different studies and to identify a reduced number of genetic features associated with stress in chickens (Gallus gallus), unravelling informative relationships and interactions by the implementation of BN algorithms. Two genetic and one epigenetic datasets evaluating the effects of stress in chickens were explored. The biology behind our findings showed that genes and epigenetic variables pointed towards chaperon-related activity of Heat Shock Proteins, apoptotic and DNA damage pathways together with wound healing mechanisms, and adherent and tight junction functionality. These genes could be crucial under the exposure to stress, especially those playing a role in keeping the correct functioning of other proteins or structures. To consider these genes as key biomarkers of stress would require further research with short- and long-term goals, working towards improving the health and welfare of poultry species in terms of management and breeding programs.</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  5. <element name="format">
    1. <element name="extent">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">174 p.</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  6. <element name="language">
    1. <element name="iso">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">eng</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  7. <element name="publisher">
    1. <element name="none">
      1. <field name="value">Universitat de Lleida</field>
      </element>
    </element>
  8. <element name="rights">
    1. <element name="license">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.</field>
        </element>
      </element>
    2. <element name="accessLevel">
      1. <element name="none">
        <field name="value">info:eu-repo/semantics/embargoedAccess</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  9. <element name="source">
    1. <element name="none">
      1. <field name="value">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</field>
      </element>
    </element>
  10. <element name="subject">
    1. <element name="ca">
      1. <field name="value">Estres</field>
      2. <field name="value">Xarxes bayesianes</field>
      3. <field name="value">Benestar animal</field>
      4. <field name="value">Redes bayesianas</field>
      5. <field name="value">Bienestar animal</field>
      6. <field name="value">Stress</field>
      7. <field name="value">Bayesian networks</field>
      8. <field name="value">Animal welfare</field>
      </element>
    2. <element name="other">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">Genètica</field>
        </element>
      </element>
    3. <element name="udc">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">573</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  11. <element name="title">
    1. <element name="ca">
      1. <field name="value">A Bayesian network approach to poultry science: discovering connections between genetic features and stress in chickens</field>
      </element>
    </element>
  12. <element name="type">
    1. <element name="none">
      1. <field name="value">info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</field>
      2. <field name="value">info:eu-repo/semantics/publishedVersion</field>
      </element>
    </element>
  13. <element name="embargo">
    1. <element name="terms">
      1. <element name="ca">
        <field name="value">12 mesos</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  </element>
2. <element name="bundles">
  1. <element name="bundle">
    1. <field name="name">ORIGINAL</field>
    2. <element name="bitstreams">
      1. <element name="bitstream">
        <field name="name">Teavr1de1.pdf</field>
        <field name="originalName">Teavr1de1.pdf</field>
        <field name="description" />
        <field name="format">application/pdf</field>
        <field name="size">1929158</field>
        <field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/2/Teavr1de1.pdf</field>
        <field name="checksum">3c32751aa83d6f2cc80666958a49a379</field>
        <field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
        <field name="sid">2</field>
        <field name="drm">open access</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  2. <element name="bundle">
    1. <field name="name">TEXT</field>
    2. <element name="bitstreams">
      1. <element name="bitstream">
        <field name="name">Teavr1de1.pdf.txt</field>
        <field name="originalName">Teavr1de1.pdf.txt</field>
        <field name="description">Extracted text</field>
        <field name="format">text/plain</field>
        <field name="size">324968</field>
        <field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/3/Teavr1de1.pdf.txt</field>
        <field name="checksum">a646915d5b7376dfc10e2516c6e6ee53</field>
        <field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
        <field name="sid">3</field>
        <field name="drm">open access</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  3. <element name="bundle">
    1. <field name="name">MEDIA_DOCUMENT</field>
    2. <element name="bitstreams">
      1. <element name="bitstream">
        <field name="name">Teavr1de1.pdf.xml</field>
        <field name="originalName">Teavr1de1.pdf.xml</field>
        <field name="description">Document Consulta</field>
        <field name="format">text/xml</field>
        <field name="size">107</field>
        <field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/687495/4/Teavr1de1.pdf.xml</field>
        <field name="checksum">3f494bb0e55cbc9c7c6de0f037117977</field>
        <field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
        <field name="sid">4</field>
        <field name="drm">open access</field>
        </element>
      </element>
    </element>
  </element>
3. <element name="others">
  1. <field name="handle">10803/687495</field>
  2. <field name="identifier">oai:www.tdx.cat:10803/687495</field>
  3. <field name="lastModifyDate">2023-02-14 18:26:40.228</field>
  4. <field name="drm">open access</field>
  </element>
4. <element name="repository">
  1. <field name="name">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</field>
  2. <field name="mail">pir@csuc.cat</field>
  </element>
</metadata>