<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<oai_dc:dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
<dc:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dc:title>
<dc:creator>Domènech Salgado, Laura</dc:creator>
<dc:contributor>Estivill, Xavier</dc:contributor>
<dc:contributor>Martí Puig, Eulàlia</dc:contributor>
<dc:contributor>Rabionet Janssen, Raquel</dc:contributor>
<dc:contributor>Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</dc:contributor>
<dc:subject>OCD</dc:subject>
<dc:subject>Genomics</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptomics</dc:subject>
<dc:subject>Metagenomics</dc:subject>
<dc:subject>TOC</dc:subject>
<dc:subject>Genòmica</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptòmica</dc:subject>
<dc:subject>Metagenòmica</dc:subject>
<dc:subject>575</dc:subject>
<dc:description>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dc:description>
<dc:description>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dc:description>
<dc:description>Programa de doctorat en Biomedicina</dc:description>
<dc:date>2019-02-18T17:00:02Z</dc:date>
<dc:date>2020-12-20T00:00:54Z</dc:date>
<dc:date>2018-12-20</dc:date>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
<dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/665800</dc:identifier>
<dc:language>eng</dc:language>
<dc:rights>L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>info:eu-repo/semantics/openAccess</dc:rights>
<dc:format>214 p.</dc:format>
<dc:format>application/pdf</dc:format>
<dc:format>application/pdf</dc:format>
<dc:publisher>Universitat Pompeu Fabra</dc:publisher>
<dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
</oai_dc:dc>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<dim:dim schemaLocation="http://www.dspace.org/xmlns/dspace/dim http://www.dspace.org/schema/dim.xsd">
<dim:field element="contributor" mdschema="dc">Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</dim:field>
<dim:field authority="53005a5b-19d5-471f-a878-af17f6586a4b" confidence="-1" element="contributor" mdschema="dc" qualifier="author">Domènech Salgado, Laura</dim:field>
<dim:field element="contributor" mdschema="dc" qualifier="authoremail">laura.domenech89@gmail.com</dim:field>
<dim:field element="contributor" mdschema="dc" qualifier="authoremailshow">true</dim:field>
<dim:field authority="300771d0-6b89-4bc6-a2e8-978919e4afe8" confidence="-1" element="contributor" mdschema="dc" qualifier="director">Estivill, Xavier</dim:field>
<dim:field authority="5fc474db-2515-4b4e-9461-23d87e2de692" confidence="-1" element="contributor" mdschema="dc" qualifier="director">Martí Puig, Eulàlia</dim:field>
<dim:field authority="482767a2-404b-4cf7-9c1f-e027dd83dfe3" confidence="-1" element="contributor" mdschema="dc" qualifier="director">Rabionet Janssen, Raquel</dim:field>
<dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="accessioned">2019-02-18T17:00:02Z</dim:field>
<dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="available">2020-12-20T00:00:54Z</dim:field>
<dim:field element="date" mdschema="dc" qualifier="issued">2018-12-20</dim:field>
<dim:field element="identifier" mdschema="dc" qualifier="uri">http://hdl.handle.net/10803/665800</dim:field>
<dim:field element="description" mdschema="dc" qualifier="abstract">To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dim:field>
<dim:field element="description" mdschema="dc" qualifier="abstract">Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dim:field>
<dim:field element="description" mdschema="dc" qualifier="degree">Programa de doctorat en Biomedicina</dim:field>
<dim:field element="format" mdschema="dc" qualifier="extent">214 p.</dim:field>
<dim:field element="format" mdschema="dc" qualifier="mimetype">application/pdf</dim:field>
<dim:field element="language" mdschema="dc" qualifier="iso">eng</dim:field>
<dim:field element="publisher" mdschema="dc">Universitat Pompeu Fabra</dim:field>
<dim:field element="rights" mdschema="dc" qualifier="license">L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dim:field>
<dim:field element="rights" lang="*" mdschema="dc" qualifier="uri">http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dim:field>
<dim:field element="rights" mdschema="dc" qualifier="accessLevel">info:eu-repo/semantics/openAccess</dim:field>
<dim:field element="source" mdschema="dc">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">OCD</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Genomics</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Transcriptomics</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Metagenomics</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">TOC</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Genòmica</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Transcriptòmica</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc">Metagenòmica</dim:field>
<dim:field element="subject" mdschema="dc" qualifier="udc">575</dim:field>
<dim:field element="title" mdschema="dc">A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dim:field>
<dim:field element="type" mdschema="dc">info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dim:field>
<dim:field element="type" mdschema="dc">info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dim:field>
<dim:field element="embargo" mdschema="dc" qualifier="terms">cap</dim:field>
</dim:dim>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<thesis schemaLocation="http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/ http://www.ndltd.org/standards/metadata/etdms/1.0/etdms.xsd">
<title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</title>
<creator>Domènech Salgado, Laura</creator>
<contributor>laura.domenech89@gmail.com</contributor>
<contributor>true</contributor>
<contributor>Estivill, Xavier</contributor>
<contributor>Martí Puig, Eulàlia</contributor>
<contributor>Rabionet Janssen, Raquel</contributor>
<subject>OCD</subject>
<subject>Genomics</subject>
<subject>Transcriptomics</subject>
<subject>Metagenomics</subject>
<subject>TOC</subject>
<subject>Genòmica</subject>
<subject>Transcriptòmica</subject>
<subject>Metagenòmica</subject>
<description>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</description>
<description>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</description>
<date>2019-02-18</date>
<date>2020-12-20</date>
<date>2018-12-20</date>
<type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</type>
<type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</type>
<identifier>http://hdl.handle.net/10803/665800</identifier>
<language>eng</language>
<rights>L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</rights>
<rights>http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</rights>
<rights>info:eu-repo/semantics/openAccess</rights>
<publisher>Universitat Pompeu Fabra</publisher>
<source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</source>
</thesis>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<record schemaLocation="http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd">
<leader>00925njm 22002777a 4500</leader>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="042">
<subfield code="a">dc</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="720">
<subfield code="a">Domènech Salgado, Laura</subfield>
<subfield code="e">author</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="260">
<subfield code="c">2018-12-20</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
<subfield code="a">To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
<subfield code="a">Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="8" ind2=" " tag="024">
<subfield code="a">http://hdl.handle.net/10803/665800</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">OCD</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Genomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Transcriptomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Metagenomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">TOC</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Genòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Transcriptòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Metagenòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="0" ind2="0" tag="245">
<subfield code="a">A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</subfield>
</datafield>
</record>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<record schemaLocation="http://www.loc.gov/MARC21/slim http://www.loc.gov/standards/marcxml/schema/MARC21slim.xsd">
<leader>nam a 5i 4500</leader>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">OCD</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Genomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Transcriptomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Metagenomics</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">TOC</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Genòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Transcriptòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="653">
<subfield code="a">Metagenòmica</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="1" ind2="0" tag="245">
<subfield code="a">A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2="1" tag="264">
<subfield code="a">[Barcelona] :</subfield>
<subfield code="b">Universitat Pompeu Fabra,</subfield>
<subfield code="c">2019</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="4" ind2="0" tag="856">
<subfield code="z">Accés lliure</subfield>
<subfield code="u">http://hdl.handle.net/10803/665800</subfield>
</datafield>
<controlfield tag="007">cr |||||||||||</controlfield>
<controlfield tag="008">AAMMDDs2019 sp ||||fsm||||0|| 0 eng|c</controlfield>
<datafield ind1="1" ind2=" " tag="100">
<subfield code="a">Domènech Salgado, Laura,</subfield>
<subfield code="e">autor</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="1" ind2=" " tag="100">
<subfield code="a">Programa de doctorat en Biomedicina,</subfield>
<subfield code="e">degree</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="300">
<subfield code="a">1 recurs en línia (214 pàgines)</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="502">
<subfield code="g">Tesi</subfield>
<subfield code="b">Doctorat</subfield>
<subfield code="c">Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</subfield>
<subfield code="d">2018</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="2" ind2=" " tag="710">
<subfield code="a">Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2="4" tag="655">
<subfield code="a">Tesis i dissertacions electròniques</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="1" ind2=" " tag="700">
<subfield code="a">Estivill, Xavier,</subfield>
<subfield code="e">supervisor acadèmic</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="1" ind2=" " tag="700">
<subfield code="a">Martí Puig, Eulàlia,</subfield>
<subfield code="e">supervisor acadèmic</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="1" ind2=" " tag="700">
<subfield code="a">Rabionet Janssen, Raquel,</subfield>
<subfield code="e">supervisor acadèmic</subfield>
</datafield>
<datafield ind1="0" ind2=" " tag="730">
<subfield code="a">TDX</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="520">
<subfield code="a">To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="998">
<subfield code="a">f</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="040">
<subfield code="a">ES-BaCBU</subfield>
<subfield code="b">cat</subfield>
<subfield code="e">rda</subfield>
<subfield code="c">ES-BaCBU</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="336">
<subfield code="a">text</subfield>
<subfield code="b">txt</subfield>
<subfield code="2">rdacontent</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="337">
<subfield code="a">informàtic</subfield>
<subfield code="b">c</subfield>
<subfield code="2">rdamedia</subfield>
</datafield>
<datafield ind1=" " ind2=" " tag="338">
<subfield code="a">recurs en línia</subfield>
<subfield code="b">cr</subfield>
<subfield code="2">rdacarrier</subfield>
</datafield>
</record>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<mets ID=" DSpace_ITEM_10803-665800" OBJID=" hdl:10803/665800" PROFILE="DSpace METS SIP Profile 1.0" TYPE="DSpace ITEM" schemaLocation="http://www.loc.gov/METS/ http://www.loc.gov/standards/mets/mets.xsd">
<metsHdr CREATEDATE="2024-09-07T09:51:28Z">
<agent ROLE="CUSTODIAN" TYPE="ORGANIZATION">
<name>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</name>
</agent>
</metsHdr>
<dmdSec ID="DMD_10803_665800">
<mdWrap MDTYPE="MODS">
<xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
<mods:mods schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">author</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>Domènech Salgado, Laura</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">authoremail</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>laura.domenech89@gmail.com</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">authoremailshow</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>true</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">director</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>Estivill, Xavier</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">director</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>Martí Puig, Eulàlia</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:name>
<mods:role>
<mods:roleTerm type="text">director</mods:roleTerm>
</mods:role>
<mods:namePart>Rabionet Janssen, Raquel</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:extension>
<mods:dateAccessioned encoding="iso8601">2019-02-18T17:00:02Z</mods:dateAccessioned>
</mods:extension>
<mods:extension>
<mods:dateAvailable encoding="iso8601">2020-12-20T00:00:54Z</mods:dateAvailable>
</mods:extension>
<mods:originInfo>
<mods:dateIssued encoding="iso8601">2018-12-20</mods:dateIssued>
</mods:originInfo>
<mods:identifier type="uri">http://hdl.handle.net/10803/665800</mods:identifier>
<mods:abstract>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</mods:abstract>
<mods:language>
<mods:languageTerm authority="rfc3066">eng</mods:languageTerm>
</mods:language>
<mods:subject>
<mods:topic>OCD</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Genomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Transcriptomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Metagenomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>TOC</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Genòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Transcriptòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Metagenòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:titleInfo>
<mods:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</mods:title>
</mods:titleInfo>
<mods:genre>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion</mods:genre>
</mods:mods>
</xmlData>
</mdWrap>
</dmdSec>
<amdSec ID="FO_10803_665800_6">
<techMD ID="TECH_O_10803_665800_6">
<mdWrap MDTYPE="PREMIS">
<xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd">
<premis:premis>
<premis:object>
<premis:objectIdentifier>
<premis:objectIdentifierType>URL</premis:objectIdentifierType>
<premis:objectIdentifierValue>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/6/tlds.pdf</premis:objectIdentifierValue>
</premis:objectIdentifier>
<premis:objectCategory>File</premis:objectCategory>
<premis:objectCharacteristics>
<premis:fixity>
<premis:messageDigestAlgorithm>MD5</premis:messageDigestAlgorithm>
<premis:messageDigest>035dce48627ee22dc5b8daed25a070c9</premis:messageDigest>
</premis:fixity>
<premis:size>6833779</premis:size>
<premis:format>
<premis:formatDesignation>
<premis:formatName>application/pdf</premis:formatName>
</premis:formatDesignation>
</premis:format>
</premis:objectCharacteristics>
<premis:originalName>tlds.pdf</premis:originalName>
</premis:object>
</premis:premis>
</xmlData>
</mdWrap>
</techMD>
</amdSec>
<amdSec ID="FT_10803_665800_8">
<techMD ID="TECH_T_10803_665800_8">
<mdWrap MDTYPE="PREMIS">
<xmlData schemaLocation="http://www.loc.gov/standards/premis http://www.loc.gov/standards/premis/PREMIS-v1-0.xsd">
<premis:premis>
<premis:object>
<premis:objectIdentifier>
<premis:objectIdentifierType>URL</premis:objectIdentifierType>
<premis:objectIdentifierValue>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/8/tlds.pdf.txt</premis:objectIdentifierValue>
</premis:objectIdentifier>
<premis:objectCategory>File</premis:objectCategory>
<premis:objectCharacteristics>
<premis:fixity>
<premis:messageDigestAlgorithm>MD5</premis:messageDigestAlgorithm>
<premis:messageDigest>a751501af9299c2c9a65e463c8fa574a</premis:messageDigest>
</premis:fixity>
<premis:size>379792</premis:size>
<premis:format>
<premis:formatDesignation>
<premis:formatName>text/plain</premis:formatName>
</premis:formatDesignation>
</premis:format>
</premis:objectCharacteristics>
<premis:originalName>tlds.pdf.txt</premis:originalName>
</premis:object>
</premis:premis>
</xmlData>
</mdWrap>
</techMD>
</amdSec>
<fileSec>
<fileGrp USE="ORIGINAL">
<file ADMID="FO_10803_665800_6" CHECKSUM="035dce48627ee22dc5b8daed25a070c9" CHECKSUMTYPE="MD5" GROUPID="GROUP_BITSTREAM_10803_665800_6" ID="BITSTREAM_ORIGINAL_10803_665800_6" MIMETYPE="application/pdf" SEQ="6" SIZE="6833779">
</file>
</fileGrp>
<fileGrp USE="TEXT">
<file ADMID="FT_10803_665800_8" CHECKSUM="a751501af9299c2c9a65e463c8fa574a" CHECKSUMTYPE="MD5" GROUPID="GROUP_BITSTREAM_10803_665800_8" ID="BITSTREAM_TEXT_10803_665800_8" MIMETYPE="text/plain" SEQ="8" SIZE="379792">
</file>
</fileGrp>
</fileSec>
<structMap LABEL="DSpace Object" TYPE="LOGICAL">
<div ADMID="DMD_10803_665800" TYPE="DSpace Object Contents">
<div TYPE="DSpace BITSTREAM">
</div>
</div>
</structMap>
</mets>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<mods:mods schemaLocation="http://www.loc.gov/mods/v3 http://www.loc.gov/standards/mods/v3/mods-3-1.xsd">
<mods:name>
<mods:namePart>Domènech Salgado, Laura</mods:namePart>
</mods:name>
<mods:extension>
<mods:dateAvailable encoding="iso8601">2019-02-18T17:00:02Z</mods:dateAvailable>
</mods:extension>
<mods:extension>
<mods:dateAccessioned encoding="iso8601">2020-12-20T00:00:54Z</mods:dateAccessioned>
</mods:extension>
<mods:originInfo>
<mods:dateIssued encoding="iso8601">2018-12-20</mods:dateIssued>
</mods:originInfo>
<mods:identifier type="uri">http://hdl.handle.net/10803/665800</mods:identifier>
<mods:abstract>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</mods:abstract>
<mods:abstract>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</mods:abstract>
<mods:language>
<mods:languageTerm>eng</mods:languageTerm>
</mods:language>
<mods:accessCondition type="useAndReproduction">L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</mods:accessCondition>
<mods:accessCondition type="useAndReproduction">http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</mods:accessCondition>
<mods:accessCondition type="useAndReproduction">info:eu-repo/semantics/openAccess</mods:accessCondition>
<mods:subject>
<mods:topic>OCD</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Genomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Transcriptomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Metagenomics</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>TOC</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Genòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Transcriptòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:subject>
<mods:topic>Metagenòmica</mods:topic>
</mods:subject>
<mods:titleInfo>
<mods:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</mods:title>
</mods:titleInfo>
<mods:genre>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</mods:genre>
<mods:genre>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</mods:genre>
</mods:mods>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<oaire:record schemaLocation="http://namespaceopenaire.eu/schema/oaire/">
<dc:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dc:title>
<datacite:creator>
<datacite:creatorName>Domènech Salgado, Laura</datacite:creatorName>
</datacite:creator>
<datacite:contributor>laura.domenech89@gmail.com</datacite:contributor>
<datacite:contributor>true</datacite:contributor>
<datacite:contributor>Estivill, Xavier</datacite:contributor>
<datacite:contributor>Martí Puig, Eulàlia</datacite:contributor>
<datacite:contributor>Rabionet Janssen, Raquel</datacite:contributor>
<datacite:contributor>Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</datacite:contributor>
<dc:subject>OCD</dc:subject>
<dc:subject>Genomics</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptomics</dc:subject>
<dc:subject>Metagenomics</dc:subject>
<dc:subject>TOC</dc:subject>
<dc:subject>Genòmica</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptòmica</dc:subject>
<dc:subject>Metagenòmica</dc:subject>
<dc:subject>575</dc:subject>
<dc:description>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dc:description>
<dc:description>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dc:description>
<dc:description>Programa de doctorat en Biomedicina</dc:description>
<dc:date>2019-02-18T17:00:02Z</dc:date>
<dc:date>2020-12-20T00:00:54Z</dc:date>
<dc:date>2018-12-20</dc:date>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
<datacite:alternateIdentifier>http://hdl.handle.net/10803/665800</datacite:alternateIdentifier>
<dc:language>eng</dc:language>
<dc:rights>L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>info:eu-repo/semantics/openAccess</dc:rights>
<dc:format>214 p.</dc:format>
<dc:format>application/pdf</dc:format>
<dc:format>application/pdf</dc:format>
<dc:publisher>Universitat Pompeu Fabra</dc:publisher>
<dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
<oaire:file>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/6/tlds.pdf</oaire:file>
</oaire:record>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<atom:entry schemaLocation="http://www.w3.org/2005/Atom http://www.kbcafe.com/rss/atom.xsd.xml">
<atom:id>http://hdl.handle.net/10803/665800/ore.xml</atom:id>
<atom:published>2020-12-20T00:00:54Z</atom:published>
<atom:updated>2019-02-18T17:00:02Z</atom:updated>
<atom:source>
<atom:generator>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</atom:generator>
</atom:source>
<atom:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</atom:title>
<atom:author>
<atom:name>Domènech Salgado, Laura</atom:name>
</atom:author>
<oreatom:triples>
<rdf:Description about="http://hdl.handle.net/10803/665800/ore.xml#atom">
<dcterms:modified>2019-02-18T17:00:02Z</dcterms:modified>
</rdf:Description>
<rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/8/tlds.pdf.txt">
<dcterms:description>TEXT</dcterms:description>
</rdf:Description>
<rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/6/tlds.pdf">
<dcterms:description>ORIGINAL</dcterms:description>
</rdf:Description>
<rdf:Description about="https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/7/tlds.pdf.xml">
<dcterms:description>MEDIA_DOCUMENT</dcterms:description>
</rdf:Description>
</oreatom:triples>
</atom:entry>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<qdc:qualifieddc schemaLocation="http://purl.org/dc/elements/1.1/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dc.xsd http://purl.org/dc/terms/ http://dublincore.org/schemas/xmls/qdc/2006/01/06/dcterms.xsd http://dspace.org/qualifieddc/ http://www.ukoln.ac.uk/metadata/dcmi/xmlschema/qualifieddc.xsd">
<dc:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dc:title>
<dc:creator>Domènech Salgado, Laura</dc:creator>
<dc:contributor>Estivill, Xavier</dc:contributor>
<dc:contributor>Martí Puig, Eulàlia</dc:contributor>
<dc:contributor>Rabionet Janssen, Raquel</dc:contributor>
<dc:subject>OCD</dc:subject>
<dc:subject>Genomics</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptomics</dc:subject>
<dc:subject>Metagenomics</dc:subject>
<dc:subject>TOC</dc:subject>
<dc:subject>Genòmica</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptòmica</dc:subject>
<dc:subject>Metagenòmica</dc:subject>
<dcterms:abstract>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dcterms:abstract>
<dcterms:abstract>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dcterms:abstract>
<dcterms:dateAccepted>2020-12-20T00:00:54Z</dcterms:dateAccepted>
<dcterms:available>2020-12-20T00:00:54Z</dcterms:available>
<dcterms:created>2020-12-20T00:00:54Z</dcterms:created>
<dcterms:issued>2018-12-20</dcterms:issued>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
<dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/665800</dc:identifier>
<dc:language>eng</dc:language>
<dc:rights>L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>info:eu-repo/semantics/openAccess</dc:rights>
<dc:publisher>Universitat Pompeu Fabra</dc:publisher>
<dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
</qdc:qualifieddc>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<rdf:RDF schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/rdf.xsd">
<ow:Publication about="oai:www.tdx.cat:10803/665800">
<dc:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dc:title>
<dc:creator>Domènech Salgado, Laura</dc:creator>
<dc:contributor>laura.domenech89@gmail.com</dc:contributor>
<dc:contributor>true</dc:contributor>
<dc:contributor>Estivill, Xavier</dc:contributor>
<dc:contributor>Martí Puig, Eulàlia</dc:contributor>
<dc:contributor>Rabionet Janssen, Raquel</dc:contributor>
<dc:subject>OCD</dc:subject>
<dc:subject>Genomics</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptomics</dc:subject>
<dc:subject>Metagenomics</dc:subject>
<dc:subject>TOC</dc:subject>
<dc:subject>Genòmica</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptòmica</dc:subject>
<dc:subject>Metagenòmica</dc:subject>
<dc:description>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dc:description>
<dc:description>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dc:description>
<dc:date>2019-02-18T17:00:02Z</dc:date>
<dc:date>2020-12-20T00:00:54Z</dc:date>
<dc:date>2018-12-20</dc:date>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
<dc:identifier>http://hdl.handle.net/10803/665800</dc:identifier>
<dc:language>eng</dc:language>
<dc:rights>L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</dc:rights>
<dc:rights>info:eu-repo/semantics/openAccess</dc:rights>
<dc:publisher>Universitat Pompeu Fabra</dc:publisher>
<dc:source>TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</dc:source>
</ow:Publication>
</rdf:RDF>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<uketd_dc:uketddc schemaLocation="http://naca.central.cranfield.ac.uk/ethos-oai/2.0/ http://naca.central.cranfield.ac.uk/ethos-oai/2.0/uketd_dc.xsd">
<dc:title>A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</dc:title>
<dc:creator>Domènech Salgado, Laura</dc:creator>
<dcterms:abstract>To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</dcterms:abstract>
<dcterms:abstract>Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</dcterms:abstract>
<uketdterms:institution>Universitat Pompeu Fabra</uketdterms:institution>
<dcterms:issued>2018-12-20</dcterms:issued>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</dc:type>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
<dc:language type="dcterms:ISO639-2">eng</dc:language>
<dcterms:isReferencedBy>http://hdl.handle.net/10803/665800</dcterms:isReferencedBy>
<dcterms:hasFormat>https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/8/tlds.pdf.txt</dcterms:hasFormat>
<uketdterms:checksum type="uketdterms:MD5">a751501af9299c2c9a65e463c8fa574a</uketdterms:checksum>
<dc:identifier type="dcterms:URI">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/6/tlds.pdf</dc:identifier>
<uketdterms:checksum type="uketdterms:MD5">035dce48627ee22dc5b8daed25a070c9</uketdterms:checksum>
<uketdterms:embargodate>cap</uketdterms:embargodate>
<dc:subject>OCD</dc:subject>
<dc:subject>Genomics</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptomics</dc:subject>
<dc:subject>Metagenomics</dc:subject>
<dc:subject>TOC</dc:subject>
<dc:subject>Genòmica</dc:subject>
<dc:subject>Transcriptòmica</dc:subject>
<dc:subject>Metagenòmica</dc:subject>
</uketd_dc:uketddc>
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<metadata schemaLocation="http://www.lyncode.com/xoai http://www.lyncode.com/xsd/xoai.xsd">
<element name="dc">
<element name="contributor">
<element name="none">
<field name="value">Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut</field>
</element>
<element name="author">
<element name="none">
<field name="value">Domènech Salgado, Laura</field>
<field name="authority">53005a5b-19d5-471f-a878-af17f6586a4b</field>
<field name="confidence">-1</field>
</element>
</element>
<element name="authoremail">
<element name="none">
<field name="value">laura.domenech89@gmail.com</field>
</element>
</element>
<element name="authoremailshow">
<element name="none">
<field name="value">true</field>
</element>
</element>
<element name="director">
<element name="none">
<field name="value">Estivill, Xavier</field>
<field name="authority">300771d0-6b89-4bc6-a2e8-978919e4afe8</field>
<field name="confidence">-1</field>
<field name="value">Martí Puig, Eulàlia</field>
<field name="authority">5fc474db-2515-4b4e-9461-23d87e2de692</field>
<field name="confidence">-1</field>
<field name="value">Rabionet Janssen, Raquel</field>
<field name="authority">482767a2-404b-4cf7-9c1f-e027dd83dfe3</field>
<field name="confidence">-1</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="date">
<element name="accessioned">
<element name="none">
<field name="value">2019-02-18T17:00:02Z</field>
</element>
</element>
<element name="available">
<element name="none">
<field name="value">2020-12-20T00:00:54Z</field>
</element>
</element>
<element name="issued">
<element name="none">
<field name="value">2018-12-20</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="identifier">
<element name="uri">
<element name="none">
<field name="value">http://hdl.handle.net/10803/665800</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="description">
<element name="abstract">
<element name="none">
<field name="value">To date, very little progress has been made towards elucidating the genetic causes of obsessive-compulsive disorder (OCD). In this project we have performed rare variant association study (RVAS) transcriptomics and metagenomics analyses to focus on areas relatively underexplored in OCD. We have identified and replicated an enrichment of rare variants in TMEM63A, a gene that encodes for a calcium-permeable cation channel, through whole-exome sequencing, RVAS and targeted resequencing analyses. Moreover, we have observed an overrepresentation of genes enriched in rare variants in OCD cases related to calcium signalling. Transcriptomic studies have identified differential expression of genes involved in neuronal development and function in OCD patients. Integration of our RVAS and transcriptomic results also uncover a possible role of semaphorins and axon guidance in OCD. Finally, metagenomics studies have confirmed the previously reported increase of the Rikenellaceae bacterial family in the gut microbiome and have shown a significant higher Actinobacteria/Fusobacteria ratio in the oro-pharyngeal microbiome of OCD cases. Our results actively encourage further research in these areas.</field>
<field name="value">Fins a dia d’avui, s’ha avançat molt poc a l’hora d’elucidar les causes genètiques del trastorn obsessiu compulsiu (TOC). En aquest projecte hem realitzat estudis d’associació de variants rares (RVAS) i anàlisis de transcriptòmica i metagenòmica per centrar-nos en àrees relativament poc explorades del TOC. Hem identificat i replicat un enriquiment de variants rares a TMEM63A, un gen que codifica un canal catiònic permeable per calci, a través d’anàlisis de seqüenciació de l’exoma complet, RVAS i reseqüenciació dirigida. A més, hem observat una sobrerepresentació de gens enriquits en variants rares en casos de TOC relacionats amb la senyalització de calci. Els estudis de transcriptòmica han identificat una expressió diferencial de gens involucrats en el desenvolupament i la funció neuronal en els pacients de TOC. La integració dels resultats dels nostres estudis de RVAS i transcriptòmica també revelen un possible paper de les semaforines i del guiatge axonal al TOC. Finalment, els estudis de metagenòmica han confirmat el increment prèviament reportat de la família bacterial Rikenellaceae en el microbioma intestinal i han mostrat una relació significativa més alta d’Actinobacteris/Fusobacteris en el microbioma de l’orofaringe dels pacients de TOC. Els nostres resultats fomenten activament la recerca en aquestes àrees.</field>
</element>
</element>
<element name="degree">
<element name="none">
<field name="value">Programa de doctorat en Biomedicina</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="format">
<element name="extent">
<element name="none">
<field name="value">214 p.</field>
</element>
</element>
<element name="mimetype">
<element name="none">
<field name="value">application/pdf</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="language">
<element name="iso">
<element name="none">
<field name="value">eng</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="publisher">
<element name="none">
<field name="value">Universitat Pompeu Fabra</field>
</element>
</element>
<element name="rights">
<element name="license">
<element name="none">
<field name="value">L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</field>
</element>
</element>
<element name="uri">
<element name="*">
<field name="value">http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/</field>
</element>
</element>
<element name="accessLevel">
<element name="none">
<field name="value">info:eu-repo/semantics/openAccess</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="source">
<element name="none">
<field name="value">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</field>
</element>
</element>
<element name="subject">
<element name="none">
<field name="value">OCD</field>
<field name="value">Genomics</field>
<field name="value">Transcriptomics</field>
<field name="value">Metagenomics</field>
<field name="value">TOC</field>
<field name="value">Genòmica</field>
<field name="value">Transcriptòmica</field>
<field name="value">Metagenòmica</field>
</element>
<element name="udc">
<element name="none">
<field name="value">575</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="title">
<element name="none">
<field name="value">A Comprehensive multiomics approach towards understanding obsessive-compulsive disorder</field>
</element>
</element>
<element name="type">
<element name="none">
<field name="value">info:eu-repo/semantics/doctoralThesis</field>
<field name="value">info:eu-repo/semantics/publishedVersion</field>
</element>
</element>
<element name="embargo">
<element name="terms">
<element name="none">
<field name="value">cap</field>
</element>
</element>
</element>
</element>
<element name="bundles">
<element name="bundle">
<field name="name">TEXT</field>
<element name="bitstreams">
<element name="bitstream">
<field name="name">tlds.pdf.txt</field>
<field name="originalName">tlds.pdf.txt</field>
<field name="description">Extracted text</field>
<field name="format">text/plain</field>
<field name="size">379792</field>
<field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/8/tlds.pdf.txt</field>
<field name="checksum">a751501af9299c2c9a65e463c8fa574a</field>
<field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
<field name="sid">8</field>
<field name="drm">open access</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="bundle">
<field name="name">ORIGINAL</field>
<element name="bitstreams">
<element name="bitstream">
<field name="name">tlds.pdf</field>
<field name="originalName">tlds.pdf</field>
<field name="format">application/pdf</field>
<field name="size">6833779</field>
<field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/6/tlds.pdf</field>
<field name="checksum">035dce48627ee22dc5b8daed25a070c9</field>
<field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
<field name="sid">6</field>
<field name="drm">open access</field>
</element>
</element>
</element>
<element name="bundle">
<field name="name">MEDIA_DOCUMENT</field>
<element name="bitstreams">
<element name="bitstream">
<field name="name">tlds.pdf.xml</field>
<field name="originalName">tlds.pdf.xml</field>
<field name="description">Document Consulta</field>
<field name="format">text/xml</field>
<field name="size">105</field>
<field name="url">https://www.tdx.cat/bitstream/10803/665800/7/tlds.pdf.xml</field>
<field name="checksum">94cfce96bbf06f1aa259ce4ba1f716aa</field>
<field name="checksumAlgorithm">MD5</field>
<field name="sid">7</field>
<field name="drm">open access</field>
</element>
</element>
</element>
</element>
<element name="others">
<field name="handle">10803/665800</field>
<field name="identifier">oai:www.tdx.cat:10803/665800</field>
<field name="lastModifyDate">2024-03-15 11:57:34.324</field>
<field name="drm">open access</field>
</element>
<element name="repository">
<field name="name">TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)</field>
<field name="mail">pir@csuc.cat</field>
</element>
</metadata>